Les produits SNIM sont dépourvus de contaminants (Phosphore, Alumine,..), et ils jouissent d’une bonne réputation sur le marché. Le contrôle de la qualité à la SNIM s'effectue sur toute la chaîne de production :

• Trous d’abattage
• Stockage Usines de Zouerate
• Trains minéraliers
• Stockage à l'usine de Nouadhibou
• Chargement navires

L'entreprise dispose de deux laboratoires d'analyses minérales à Zouerate et à Nouadhibou. Le laboratoire de Nouadhibou permet notamment de contrôler en temps réel les teneurs des cargaisons en cours de chargement au niveau du port.